Option Mathématiques pures
Tous les cours sont à option mais doivent comprendre au moins 12 crédits de cours de sigle MAT. Les exigences de la maîtrise en mathématiques doivent être remplies.
Option Mathématiques appliquées
Tous les cours sont à option mais doivent comprendre au moins 12 crédits de cours de sigle MAT, ou, le cas échéant, 9 crédits de cours de sigle MAT et 3 crédits dans la discipline d’application. Les exigences de la maîtrise en mathématiques appliquées doivent être remplies.
Pour les deux options, le choix de cours doit être approuvé par le Comité des études supérieures en mathématiques. Le Département s'attend à ce que l'étudiant participe régulièrement, et ce tout au long de ses études, aux séminaires des étudiants de 2e et 3e cycles de mathématiques.
Option Mathématiques de l'ingénieur
Tous les cours sont au choix parmi les répertoires des cours des études supérieures du Département de mathématiques et génie industriel de l'École Polytechnique et dans celui des études supérieures de l'Université de Montréal, en particulier ceux du Département de mathématiques et de statistique et du Département d'informatique et de recherche opérationnelle.